Организация "ПБ Флагман" основана 26 апреля 2008 года группой молодых специалистов. В настоящее время компания состоит из 9 инженеров по всем необходимым специальностям (специалисты по электрооборудованию, по механической и по корпусной части судна). Предприятие базируется на территории ОАО "Новосибирский речной порт".
ПБ Флагман получило признание на выполнение работ по разработке технической и проектной документации на строительство несамоходных судов с классом Российского Речного Регистра. Свидетельство было подписано западно-сибирским филиалом РРР в ноябре 2017 года.
Клиентами ООО "ПБ Флагман" являются как крупные, так и мелкие судоходные компании, а также частные судовладельцы на территории от п. Анадырь на Востоке, до Калининграда на Западе и начиная от п. Ямбург на Севере до Ростова-на-Дону на Юге. ООО "ПБ Флагман" имеет опыт согласования документации с Российским Речным Регистром, с Российским Морским Регистром Судоходства, а также с ГИМС МЧС России.