В годы Великой Отечественной войны Арктический институт находился в ведении Главного управления Северного морского пути и занимался исследованиями Арктики, а также выполнял важные практические задачи, связанные с обеспечением гидрометеорологическими прогнозами мореплавания по Севморпути. Служба льда и погоды АНИИ обслуживала всю трассу, ее районные бюро погоды действовали в Амдерме, на острове Диксон, в поселке Тикси, на мысе Шмидта, в Анадыре. Сотрудники института работали также в штабах морских операций, гидрологами-бортнаблюдателями при проведении авиационных ледовых разведок, в составе морских ледовых патрулей, на полярных станциях.
Война заставила перестроить работу института. Уже в июле 1941 года было определено, что учреждения Главсевморпути эвакуируются в Красноярск — город, который являлся одним из центров полярной авиации. В конце июля из Ленинграда туда отправили самые ценные экспонаты Музея Арктики, но сам институт эвакуироваться не успел из-за начала блокады Ленинграда. В сложнейших условиях сотрудники АНИИ не только смогли сохранить научные фонды и здание института, но и продолжали исследования, обороняли город. Эвакуация была осуществлена в феврале – апреле 1942 года.

На выставке, открывшейся 7 мая в здании Арктического антарктического научно-исследовательского института, представлены материалы, повествующие о работе сотрудников АНИИ в годы войны — в Ленинграде, Красноярске, экспедициях, на полярных станциях. Также рассказывается о развитии полярной науки и вкладе сотрудников в обеспечение грузоперевозок по Севморпути, о создании справочных пособий и инструкций, о подготовке кадров полярников в военное время.
Отдельный раздел выставки посвящен погибшим сотрудникам института, сообщает ААНИИ.
Война в нашей стране коснулась практически каждой семьи. В коллектив ААНИИ приходили новые сотрудники — фронтовики, блокадники. На выставке представлены наградные документы сотрудников, поступивших на работу в институт в послевоенные годы.