В апреле 2003 года компания ОАО «Санкт-Петербургский речной порт» вошла в состав Группы ЛСР, после чего произошли существенные изменения в организации управления портом и оптимизация финансовых потоков. В результате, несмотря на то, что порт работал лишь 8 месяцев из-за сложной ледовой обстановки в начале 2003 года, грузооборот вырос на 13% и составил 1,03 миллиона тонн, из которых: внутренних грузов – 680 тысяч тонн, экспортно-импортных грузов – 350 тысяч тонн. Грузооборот судовых партий составил 608 тыс тонн, что на 18% больше, чем в 2002г. Объем реинвестиций в основные мощности увеличен, по сравнению с прошлым годом, на 50% и составил 16,5 миллионов рублей.
На территории порта реализуется ряд крупных инвестиционных проектов Группы ЛСР. Разработана стратегия развития порта, совершенствуются технологии выполнения погрузо-разгрузочных работ, внедрена программа повышения квалификации и обучения личного состава порта. К лету 2004 года будет окончательно введена в действие новая информационная система, отвечающая всем современным стандартам бухгалтерского и управленческого учёта.