По версии следствия, в октябре 2022-августе 2023 года Пинько, а также иные сотрудники ООО "Спрут-Сервис" и иные неустановленные лица, находясь в Санкт-Петербурге и Москве, с целью хищения имущества ФГБУ науки "Институт океанологии им. П.П. Ширшова Российской академии наук", при исполнении контракта на выполнение работ по капитальному ремонту научно-исследовательского судна "Академик Николай Страхов" (в части модернизации), действуя группой лиц по предварительному сговору, изготовили и предоставили должностным лицам "ИО РАН" для оплаты в адрес ООО "Спрут-Сервис" документы, содержащие недостоверные сведения об объемах и стоимости якобы выполненных работ (оказанных услуг), которые фактически не выполнялись и (или) содержали сведения о завышенных объемах выполненных работ (услуг), на общую сумму 8 142 765, 34 рублей.
17 сентября 2025 года Игорь Пинько был задержан, обвинение ему не предъявлялось, сообщает Telegram-канал Объединённая пресс-служба судов Санкт-Петербурга.

5 сентября 2024 года во время экспедиции в Карском море у судна "Академик Николай Страхов"остановился главный двигатель. Его пришлось буксировать в Мурманск.