Научные исследования и разработки НИЛИМ проводит в тесном сотрудничестве с Нижегородским филиалом Института машиноведения РАН, Нижегородским государственным университетом им. Н.И. Лобачевского, ИЭС им. Е.О. Патона и другими научно-исследовательскими и промышленными организациями.
Кроме того, деятельность предприятия скоординирована с Федеральной целевой программой "Интеграция" (проект № 0542), Российским Речным Регистром, Морским Регистром Судоходства крупными отраслевыми исследовательскими институтами и промышленными предприятиями региона.
Такое сотрудничество способствует внедрению результатов фундаментальной науки в производственную практику промышленных предприятий региона.