Высочайшим указом от 23 марта 1781 года Ярославскому и Вологодскому генерал-губернатору Алексею Петровичу Мельгунову было предложено учредить в Холмогорах мореходную школу.
В мореходной школе полагались следующие классы: российской грамоты и письма, арифметики, геометрии и тригонометрии, купеческой навигации, сферики, астрономии, круглой навигации, морской картографии, голландского, английского, немецкого и французского языков.
Занятия в школе начались только в октябре 1781 года. Лишь в августе 1782 года в Холмогоры было доставлено пять ящиков с книгами и инструментами. В регистре вещей значились: 2 астролябии, 10 "гантирских шкал", 15 "сектуров", 15 геометрических инструментов, 1 градшток, 1 квадрант, а также логарифмические таблицы, учебники по навигации, астрономии, геометрии, грамматике и азбуки на немецком языке.
Старейшая в России, мореходная школа в Холмогорах была первым профессиональным учебным заведением в Архангельской губернии. С даты основания мореходной школы ведет отсчет своей истории старейшее на сегодняшний день учебное заведение Архангельска - Арктический морской институт имени В.И.Воронина – филиал Государственного университета морского и речного флота имени адмирала С.О. Макарова.
Более 30 выпускников учебного заведения в годы войны командовали боевыми кораблями. Троим выпускникам - Ивану Красносельскому, Дмитрию Пономареву и Архипу Шестакову – присвоены звания Герой Советского Союза.
