Для хранения и последующего анализа информации, получаемой многоканальным СПК предлагается схема, основанная на ГИС-технологии. При реализации данной технологии результаты непрерывных измерений показателей состава и свойств поверхностных вод вдоль всего маршрута движения судна, включая результаты измерений, полученных на стоянках, записываются в электронные архивы. Все измерения привязаны ко времени их проведения и географическим координатам с помощью спутниковой навигационной системы, установленной на судне. ГИС эколога даёт возможность отображать не только качественные и количественные характеристики исследуемого объекта (водозабора, водосброса, промышленного предприятия и т.д.), но и его местоположения на электронной карте исследуемого района в окружении определённого сочетания других объектов.