Свыше 41,6 млн. рублей направлено на проектные работы и строительство очистных сооружений и локальных очистных систем на новых объектах, строящихся в рамках реализации программы развития группы компаний: «Универсальном перегрузочном комплексе» в Усть-Луге (0,5 млн. рублей), ро-ро терминале Первой стивидорной компании (36,8 млн. рублей), Контейнерном терминале Четвертой стивидорной компании (4,6 млн. рублей).
На ремонт и комплексное техническое обслуживание очистных сооружений и ливневых канализаций на территории Первой, Второй и Четвертой стивидорных компаний группы направлено 6,9 млн. рублей.
Компаниями группы «Морской порт Санкт-Петербург» ведется систематический контроль за выполнением норм и требований природоохранного и санитарного законодательства. В течение года ведется мониторинг качества и реализуется комплекс мер по защите атмосферного воздуха, земельных и водных ресурсов от отходов производства и потребления: ведется строгий учет объемов образующихся отходов и периодичности их вывоза. В 2009 году на эти цели направлено 18,8 млн. рублей.
